Po powrocie z Himalajów,
gdzie Lara przeżyła ciekawą
przygodę z Yeti, nasza bohaterka
zatrzymuje się w hotelu by zebrać
siły po poprzedniej przygodzie. Na
miejscu spotyka Larsona -
przedstawiciela firmy Natla
Technogies. Wkrótce od jego szefowej
- Jaqueline Natli - otrzymuje
propozycję pracy. Chodzi o
odnalezienie artefaktu zwanego Scion
ukrytego w grobowcu Qualopeca w
mroźnych rejonach Peru. Lara od razu
zwęsza wielką przygodę i przyjmuje
wyzwanie. Po wielu trudnościach
zdobywa ów przedmiot lecz jednocześnie
dowiaduje się, że posiada jedynie
jedną część tajemniczego
artefaktu. Ze zdobytych w czasie
włamania zapisek Natli dowiaduje
się, że kolejna część znajduje
się w podziemiach klasztoru
starożytnego Rzymu. Natomiast
miejsce ukrycia ostatniej części
odsłania jej wizja - jest ona
gdzieś w Egipcie. Niedługo
wychodzą na jaw nowe fakty. Lara
dowiaduje się, że Natla jest
niedawno przywróconą do życia,
jedną z trzech władców mistycznej
Atlantydy. Pozostali dwaj dawno już
nieżyją a grobowce które odwiedziła
należą właśnie do nich. Teraz
Natla próbuje odzyskać swoją
potęgę korzystając z mocy
drzemiącej w Scionie. Niestety przy
wyjściu z kompleksu w Egipcie Lara
wpada w zasadzkę i artefakt
przejmuje Natla. Lara cudem unika
śmierci. Udaje jej się jeszcze
dostać na statek swych wrogów, wraz
z nimi dociera do wyspy i wkrótce
trafia do kopalni firmy Natla
Technologies. Wkrótce odnajduje wejście
do tajemniczej budowli. Jak się
potem okazuje, pozostałości
Atlantydy. Na miejscu Lara spotyka
Natlę i ostatecznie ją pokonuje. W
tej samej chwili wszystko zaczyna
się walić. Nie ma czasu na
rozmyślania. Lara w wielkim
pośpiechu opuszcza kopalnię i w
ostatnim momencie ucieka z wyspy, która
funduje sobie wspaniały wybuch...